一家生物公司为了研究不同物种基因的重组情况，于是派工作人员通过非法途径进入了一个生态保护地区，他们将在那里进行一系列生物基因实验。他们在那里抓捕了一只巨大鳄鱼作为培养皿，想通过这只鳄鱼培育实验室中的怪蛇。可是因为麻醉剂量不足，鳄鱼在实验中苏醒了，紧接着实验室就被疯狂的鳄鱼摧毁了，实验室的怪蛇也因此逃脱了。离这个保护区最近的小镇因为这两只怪物，几乎遭受了灭顶之灾，幸得小镇警长Reba找到了一个方法来消灭了这两个怪物，避免它们杀了整个城镇的人。

一个培养鳄鱼和蟒蛇的基因实验因为出现失误，让鳄鱼和巨蟒逃离了实验室。于是《史前巨鳄》 中的杀手鳄鱼和《狂蟒之灾》 中的巨蟒同时出现在这部最 新的影片中。警长Reba和野生物学家Tully因此联手合作，拯救整个小镇和居民。